Ong là loài thụ phấn, biến một vùng hoa thành nguồn mật ong và sáp ong tái tạo. Ong sống trong tổ ong, xuất hiện trên cây ở rừng hoa, đồng cỏ, đồng bằng và rừng anh đào, và trong tổ ong, phiên bản chế tạo của tổ. Khác biệt giữa tổ ong (bee hive) và tổ ong tự nhiên (bee nest) chỉ là khối đó đến từ đâu. Cả hai đều chứa tối đa ba con ong và được lấp đầy theo cách giống nhau.
Khó nhất là đưa ong vào tổ ong, vì ong không thể thuần hóa: chúng luôn quay về tổ đã có. Dùng công cụ có Silk Touch để lấy tổ khi ong còn bên trong, chúng sẽ đi theo khối. Phá tổ mà không có Silk Touch sẽ hủy tổ và cả đàn ong sẽ tấn công bạn. Đặt tổ gần hoa, ong sẽ rời đi thụ phấn rồi tự quay về, và mỗi con ong được nhân giống sau đó sẽ tìm tổ trống gần nhất, đó là cách một trại ong tự phát triển.
Tổ ong đầy dần qua năm mức mật và nhỏ mật ở đáy khi đầy. Kéo (shears) lấy sáp ong, chai thủy tinh lấy mật, và cả hai đều chọc giận mọi con ong trong phạm vi, trừ khi khói lửa trại đang bay lên từ dưới tổ. Một máy phóng có kéo hoặc chai sẽ thu hoạch mà không gây chuyện, đó là nền tảng của trại ong tự động.
Ong thụ phấn sẽ làm nhanh sự phát triển của cây trồng nó đi qua, nên tổ ong cạnh ruộng lúa mì vừa là nguồn mật vừa là nguồn tăng năng suất. Ong đi theo người chơi cầm hoa, có thể dắt bằng dây, và sinh sản gần như trên bất kỳ loài hoa nào. Khi đốt, ong mất mạng: nọc độc để lại độc và con ong chết không lâu sau đó. Vì vậy đàn ong giận dữ tự thu hẹp, dù khói vẫn là cách rẻ hơn để xử lý.